Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms