Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DCLRE1CQ96SD1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms