Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SORCS2Q96PQ0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms