Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC7Q96M83 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC7Q96M83 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms