Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EP400Q96L91 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms