Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DCHS1Q96JQ0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms