Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BCANQ96GW7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BCANQ96GW7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms