Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BICD1Q96G01 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms