Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC97Q96F63 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms