Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIRT1Q96EB6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms