Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF428Q96B54 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF428Q96B54 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms