Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM63Q969Q1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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