Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms