Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LCN9Q8WX39 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LCN9Q8WX39 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms