Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
FAT3Q8TDW7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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