Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CSNK2A3Q8NEV1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms