Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPC24Q8NBT2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPC24Q8NBT2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPC24Q8NBT2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPC24Q8NBT2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPC24Q8NBT2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPC24Q8NBT2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SPC24Q8NBT2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPC24Q8NBT2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPC24Q8NBT2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPC24Q8NBT2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SPC24Q8NBT2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SPC24Q8NBT2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SPC24Q8NBT2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPC24Q8NBT2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms