Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PNLDC1Q8NA58 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PNLDC1Q8NA58 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms