Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SAMD12Q8N8I0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms