Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDKL3Q8IVW4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDKL3Q8IVW4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms