Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT27Q7Z3Y8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT27Q7Z3Y8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms