Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NUP54Q7Z3B4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms