Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TCF23Q7RTU1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TCF23Q7RTU1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms