Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PREX2Q70Z35 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PREX2Q70Z35 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms