Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
USP34Q70CQ2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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