Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
XIRP1Q702N8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XIRP1Q702N8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms