Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf47Q6ZRZ4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf47Q6ZRZ4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf47Q6ZRZ4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf47Q6ZRZ4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf47Q6ZRZ4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf47Q6ZRZ4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf47Q6ZRZ4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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C9orf47Q6ZRZ4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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