Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC9Q6ZRR7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC9Q6ZRR7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms