Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LIAT1Q6ZQX7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LIAT1Q6ZQX7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms