Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD4L3Q6VB84 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD4L3Q6VB84 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms