Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L9Q6RFH8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms