Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL35Q6PF15 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms