Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMOD2Q6P5Q4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms