Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q6P435 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q6P435 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q6P435 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q6P435 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms