Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H3F3CQ6NXT2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H3F3CQ6NXT2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H3F3CQ6NXT2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H3F3CQ6NXT2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H3F3CQ6NXT2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H3F3CQ6NXT2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H3F3CQ6NXT2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms