Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRNP1Q6NT89 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms