Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL1Q5VZK9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL1Q5VZK9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms