Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf135Q5VTT2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms