Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PXDC1Q5TGL8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms