Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SAMD5Q5TGI4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms