Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PERM1Q5SV97 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms