Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC39AQ5SRH9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC39AQ5SRH9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms