Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ALFQ53S48 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms