Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP100Q494V2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms