Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC153Q494R4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms