Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KLHL38Q2WGJ6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KLHL38Q2WGJ6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms