Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GEN1Q17RS7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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