Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP2B3Q16720 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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