Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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SGCAQ16586 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SGCAQ16586 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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SGCAQ16586 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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SGCAQ16586 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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SGCAQ16586 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SGCAQ16586 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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