Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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CCDC6Q16204 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CCDC6Q16204 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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